FK „Inđija“ posvećuje posebnu pažnju svojoj fudbalskoj školi. Sve tri selekcije (pioniri, kadeti i omladinci) uključene su u takmičenje pod okriljem FS Vojvodine gde beleže zapažene rezultate. Nastupima u takmičenju sa vršnjacima iz renomiranih fudbalskih klubova širom Vojvodine stiču neophodno takmičarsko iskustvo, usavršavaju tehničko taktičko znanje ali i beleže vredne rezultate. Omladinci su jesenji deo prvenstva završili na prvom mestu, ostavivši iza sebe predstavnike renomiranih fudbalskih škola novosadske Vojvodine, kulskog Hajduka, Proletera iz Zrenjanina. Ono što je najvrednije čak petorica polaznika klupske škole obukla su tokom jeseni dres prvog tima.